Στη στοµατοπροσωπική περιοχή εμφανίζεται πλήθος τοπικών νόσων και παθήσεων, αλλά και  µεγάλος αριθµός συστηµατικών νόσων και συνδρόµων που παρουσιάζουν ενδοστοματικές εκδηλώσεις. Τα νοσήµατα αυτά παρουσιάζουν ποικιλοµορφία στην ένταση και στη διάρκεια, προσβάλλουν κάθε ηλικία και ανάλογα με τη  συµπτωµατολογία είναι δυνατόν να έχουν σοβαρές επιπτώσεις για την υγεία.

Παρακάτω γίνεται μια σύντομη αναφορά στις συχνότερες ή σημαντικότερες παθήσεις του στόματος.

  • Άφθες
  • Πέμφιγα – πεμφιγοειδές
  • Λοιµώξεις (π.χ., έρπης, µυκητιάσεις)
  • Τριχωτή – γεωγραφική γλώσσα
  • Προκαρκινικές βλάβες (λευκοπλακία)
  • Ξηροστομία
  • Καρκίνος στόματος
  • Καυσαλγία στόματος
  • Όγκοι και κύστες μαλακών μορίων (π.χ. ίνωμα, θήλωμα, κονδύλωμα, βλεννοκήλη)
  • Κακοσμία στόματος
  • Ομαλός λειχήνας